睡蓮的葉呈圓形或近圓形，或卵圓形，而有些品種呈披針形或箭形；葉全緣，但熱帶睡蓮的葉緣呈波紋狀；葉正面綠色，光亮，背面紫紅色，某些品種的頁面有暗褐色斑點或斑駁色；葉脈明顯或不太明顯。而熱帶睡蓮中少數品種的葉片在大缺裂頂端處與葉柄著生點之間，長出小植株，稱之"胎生"。

睡蓮的花朵由萼片、花瓣、雌雄蕊、花柱、心皮、花柄等器官所組成。花單生，為兩性。其萼片4~5枚，呈綠色或紫紅色，或綠中帶黑點，形狀有披針形、窄卵形，或者矩圓形。花蕾呈長桃形、桃形；花瓣通常有卵形、寬卵形、矩圓形、長圓形、倒卵形、寬披針形等，瓣端稍尖，或略鈍。花色有紅、粉紅、藍、紫、白等。花瓣有單瓣、多瓣、重瓣。因而花瓣的大小、形狀、顏色均因品種而異。從此構成了絢麗的花態。子房上位至周位，花開前雄蕊裹住心皮上方，成熟后則張開成鐮刀狀；萼片、花瓣、雄蕊在花托與子房壁的上方呈螺旋排列。心皮則成環狀排列包埋于花托之內且呈合生狀態，上部花柱分離、柱頭絲狀、以乳狀突出物為中心，呈漏斗狀，成熟時分泌出柱頭物，而柱頭物主要含葡萄糖、果糖及氨基酸，以吸引昆蟲授粉。